Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LTAP01374 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LTAP01374 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LTAP01374 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LTAP01374 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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