Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms