Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM4O75871 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM4O75871 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms