Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms