Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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