Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms