Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCAO15360 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCAO15360 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCAO15360 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCAO15360 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCAO15360 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCAO15360 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCAO15360 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCAO15360 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms