Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms