Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms