Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C5orf49A4QMS7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms