Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPS5Q9UPZ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms