Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms