Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP1Q9UPQ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms