Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD1Q9UP38 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD1Q9UP38 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD1Q9UP38 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD1Q9UP38 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms