Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms