Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms