Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms