Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms