Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms