Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NXPE2Q96DL1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms