Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms