Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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