Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NANOGP8Q6NSW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms