Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WASHC2DQ5SRD0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms