Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD5Q16401 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD5Q16401 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms