Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIP13Q15645 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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