Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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