Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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COL4A6Q14031 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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COL4A6Q14031 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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COL4A6Q14031 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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COL4A6Q14031 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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