Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms