Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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C1orf61Q13536 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C1orf61Q13536 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C1orf61Q13536 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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