Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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