Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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