Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms