Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms