Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms