Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B2Q01814 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms