Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms