Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms