Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms