Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms