Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms