Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms