Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SDSP20132 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDSP20132 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDSP20132 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDSP20132 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDSP20132 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDSP20132 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDSP20132 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDSP20132 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDSP20132 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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