Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms