Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms