Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms