Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms