Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TIMM17BO60830 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms