Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCEO43556 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms