Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNMO15061 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms